Владельцы видеокарт NVIDIA могут повысить скорость кодирования в H.264 за счет ресурсов GPU. Для этого попробуйте использовать кодек h264_nvenc.
ffmpeg -i input.mp4 -c:v h264_nvenc -c:a copy output.mp4
Сборка FFMpeg должна поддерживать кодек h264_nvenc и быть совместима с драйвером видеокарты.